Yayınlar

Yayın Adı Bölüm Birimartan sırada Yayın Türü İndeksi Tarihi
Lustig, B., Bahar, İ., Jernigan, R.L., “RNA bulge entropies in the unbound state correlate with peptide binding strengths for Hiv-1 and Biv tar RNA because of improved conformational access”, Nucleic Acids Research, 26, 22, 5212-5217, 1998. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 1998
Haliloğlu, T., Cho, J.H., Mattice, W., “Simulation of rotational isomeric state models for polypropylene melts on a high coordination lattice”, Abstracts of Papers of the American Chemical Society, 215, U341-U341, 1998. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E 1998
Haliloğlu, T., Cho, J.H., Mattice, W.L., “Simulations of rotational isomeric state models for poly(propylene) melts on a high coordination lattice”, Macromolecular Theory and Simulations, 7, 6, 613-617, 1998. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 1998
Alparslan, A.K., Sayar, M., Atılgan, A.R., “State space prediction model for chaotic time series”, Physical Review E, 58, 2, 2640-2643, 1998. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 1998
Erdal, S., Bahar, İ., Erman, B., “Swelling of sodium chloride filled polybutadiene networks in water, water/acetone and water/thf mixtures”, Polymer, 39, 10, 2035-2041, 1998. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 1998
Bahar, İ., Atılgan, A.R., Demirel, M.C., Erman, B., “Vibrational dynamics of folded proteins: Significance of slow and fast motions in relation to function and stability”, Physical Review Letters, 80, 12, 2733-2736, 1998. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 1998
Bahar, İ., Jernigan, R.L., “Vibrational dynamics of transfer RNAS: Comparison of the free and synthetase bound forms”, Journal of Molecular Biology, 281, 5, 871-884, 1998. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 1998
Keskin, O., Bahar, İ., Jernigan, R., Covell, D., “Characterization of anticancer agents and their growth inhibitory potency: Relationships between potency and chemical substructure”, Biophysical Journal, 76, 1, A384-A384, 1999. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E 1999
Haliloğlu, T., “Characterization of internal motions of escherichia coli ribonuclease H by Monte Carlo Simulation”, Proteins Structure Function and Genetics, 34, 4, 533-539, 1999. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 1999
Haliloğlu, T., “Coarse grained simulations of the conformational dynamics of proteins”, Computational and Theoretical Polymer Science, 9, 3-4, 255-260, 1999. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 1999
Bahar, İ., Erman, B., Jernigan, R.L., Atılgan, A.R., Covell, D.G., “Collective motions in Hiv-1 reverse transcriptase: Examination of flexibility and enzyme function”, Journal of Molecular Biology, 285, 3, 1023-1037, 1999. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 1999
Kurt, N., Haliloğlu, T., “Conformational dynamics of chymotrypsin inhibitor 2 by coarse grained simulations”, Proteins Structure Function and Genetics, 37, 3, 454-464, 1999. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 1999
Haliloğlu, T., “Conformational dynamics of cytochrome C by coarse grained simulations”, Abstracts of Papers of the American Chemical Society, 218, U656-U656, 1999. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E 1999
Bahar, İ., Jernigan, R.L., “Cooperative fluctuations and subunit communication in tryptophan synthase”, Biochemistry, 38, 12, 3478-3490, 1999. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 1999
Haliloğlu, T., Mattice, W.L., “Detection of the onset of demixing in simulations of polypropylene melts in which the chains differ only in stereochemical composition”, Journal of Chemical Physics, 111, 9, 4327-4333, 1999. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 1999
Bahar, İ., “Dynamics of proteins and biomolecular complexes: Inferring functional motions from structure”, Reviews in Chemical Engineering, 15, 4, 319-347, 1999. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri İnceleme SCI-E 1999
Nugay, N., Kahraman, M., “Hybrid reinforcement in polydimethylsiloxane composites”, Abstracts of Papers of the American Chemical Society, 218, U656-U656, 1999. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E 1999
Şen, T.Z., Bahar, İ., Erman, B., Laupretre, F., Monnerie, L., “Local dynamics of CIS 1,4 polybutadiene and CIS 1,4-polyisoprene. A comparative study based on cooperative kinematics theory and NMR experiments”, Macromolecules, 32, 9, 3017-3024, 1999. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 1999
Demirel, M.C., Bahar, İ., Atılgan, A.R., “Predicting the ensemble of unfolding pathways for proteins: An updated incremental Lagrangean model”, Biophysical Journal, 76, 1, A176-A176, 1999. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E 1999
Jernigan, R.L., Demirel, M.C., Bahar, İ., “Relating structure to function through the dominant slow modes of motion of DNA topoisomerase II”, International Journal of Quantum Chemistry, 75, 3, 301-312, 1999. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 1999
Haliloğlu, T., Mattice, W.L., “Simulation of rotational isomeric state models for polypropylene melts on a high coordination lattice”, Reviews in Chemical Engineering, 15, 4, 293-305, 1999. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri İnceleme SCI-E 1999
Haliloğlu, T., Bahar, İ., “Structure based analysis of protein dynamics: Comparison of theoretical results for hen lysozyme with X-ray diffraction and NMR relaxation data”, Proteins Structure Function and Genetics, 37, 4, 654-667, 1999. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 1999
Bahar, İ., Jernigan, R.L., “Subunit communication, processing and fluctuations in tryptophan synthase”, Biophysical Journal, 76, 1, A115-A115, 1999. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E 1999
Keskin, O., Bahar, İ., Jernigan, R.L., Beutler, J.A., Shoemaker, R.H., Sausville, E.A., Covell, D.G., “Characterization of anticancer agents by their growth inhibitory activity and relationships to mechanism of action and structure”, Anti-Cancer Drug Design, 15, 2, 79-98, 2000. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2000
Haliloğlu, T., Bahar, İ., Jernigan, R.L., “Collective dynamics of class I MHC/peptide complexes and binding to T cell receptors”, Biophysical Journal, 78, 1, 34A-34A, 2000. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E 2000
Kurt, N., Haliloğlu, T., “Conformational dynamics of Chymotrypsin Inhibitor 2 in free and complex forms”, Abstracts of Papers of the American Chemical Society, 220, U355-U355, 2000. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E 2000
Doruker, P., Atılgan, A.R., Bahar, İ., “Dynamics of proteins predicted by molecular dynamics simulations and analytical approaches: Application to alpha-amylase inhibitor”, Proteins-structure Function and Genetics, 40, 3, 512-524, 2000. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2000
Şen, S., Nugay, N., “Effect of surface of hybrid filler systems on curing characteristics of polyesters”, Abstracts of Papers of the American Chemical Society, 220, U357-U357, 2000. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E 2000
Nugay, N., Nugay, T., “Inter polymer complexes of poly(methyl methacrylate)block-poly(4-vinylpyridine) with polyacrylic acid and polyacrylic acid-block-poly(methyl methacrylate)”, European Polymer Journal, 36, 5, 1027-1033, 2000. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2000
Konyalı, H., Bahar, Y., Nugay, N., “Linear and star branched polybutadiene blend networks: Curing, swelling, and dynamic mechanical behavior”, Abstracts of Papers of the American Chemical Society, 220, U356-U356, 2000. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E 2000
İşeri, R., Küsefoğlu, S.H., “New monomers and polymers derived from alpha-hydroxymethyl methyl vinyl ketone”, Journal of Applied Polymer Science, 77, 3, 509-516, 2000. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2000
Keskin, O., Jernigan, R.L., Bahar, İ., “Proteins with similar architecture exhibit similar large-scale dynamic behavior”, Biophysical Journal, 78, 4, 2093-2106, 2000. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2000
Jernigan, R.L., Bahar, İ., Covell, D.G., Atılgan, A.R., Erman, B., Flatow, D.T., “Relating the structure of HIV-1 reverse transcriptase to its processing step”, Journal of Biomolecular Structure & Dynamics, 49-55, 2000. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri SCI-E, CPCI-S 2000
Şen, S., Nugay, N., “Uncured and cured state properties of fly ash filled unsaturated polyester composites”, Journal of Applied Polymer Science, 77, 5, 1128-1136, 2000. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2000
Atılgan, A.R., Durell, S.R., Jernigan, R.L., Demirel, M.C., Keskin, O., Bahar, İ., “Anisotropy of fluctuation dynamics of proteins with an elastic network model”, Biophysical Journal, 80, 1, 505-515, 2001. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2001
Işın, B., Bahar, İ., Doruker, P., “Collective motions of neutral and low pH forms of influenza virus hemagglutinin”, Biochemistry, 40, 29, 8615-8615, 2001. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E 2001
Işın, B., Bahar, İ., Doruker, P., “Collective motions of neutral and low pH forms of influenza virus hemagglutinin.”, Abstracts of Papers of the American Chemical Society, 222, U121-U121, 2001. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E 2001
Kurt, N., Haliloğlu, T., “Conformational dynamics of subtilisin-chymotrypsin Inhibitor 2 Complex by coarse-grained simulations”, Journal of Biomolecular Structure & Dynamics, 18, 5, 713-731, 2001. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2001
Doruker, P., Mattice, W.L., “Effect of surface roughness on structure and dynamics in thin films”, Macromolecular Theory and Simulations, 10, 4, 363-367, 2001. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2001
Nugay, N., Erman, B., “Hybrid reinforcement in nitrile rubber composites”, Macromolecular Symposia, 169, 269-274, 2001. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri SCI-E, CPCI-S 2001
Konuklar, F.A.S., Aviyente, V., Şen, T.Z., Bahar, İ., “Modeling the deamidation of asparagine residues via succinimide intermediates”, Journal of Molecular Modeling, 7, 5, 147-160, 2001. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2001
Bokobza, L., Nugay, N., “Orientational effect of mica in fumed silica reinforced composites”, Journal of Applied Polymer Science, 81, 1, 215-222, 2001. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2001
Nugay, N., Erman, B., “Property optimization in nitrile rubber composites via hybrid filler systems”, Journal of Applied Polymer Science, 79, 2, 366-374, 2001. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2001
Can, E., Küsefoğlu, S., Wool, R.P., “Rigid, thermosetting liquid molding resins from renewable resources I. synthesis and polymerization of soy oil monoglyceride maleates”, Journal of Applied Polymer Science, 81, 1, 69-77, 2001. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2001
Şen, S., Nugay, N., “Swelling, viscosity and static mechanical behaviour of polyester composites based on hybrid filler system”, Macromolecular Symposia, 175, 421-428, 2001. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri SCI-E, CPCI-S 2001
Nugay, N., Şahin, Y.M., “Thixotropic behavior of nitrile rubber composites containing waste rubber vulcanizates and carbon black.”, Abstracts of Papers of the American Chemical Society, 222, U310-U310, 2001. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E 2001
Özkan, S.B., Bahar, İ., Dill, K.A., “Transition states and the meaning of phi values in protein folding kinetics”, Nature Structural Biology, 8, 9, 765-769, 2001. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2001
Şen, S., Nugay, N., “Tuning of final performances of unsaturated polyester composites with inorganic microsphere/platelet hybrid reinforcers”, European Polymer Journal, 37, 10, 2047-2053, 2001. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2001
Ersoy, O., Nugay, N., “Weld line strength of polypropylene/polyamide blends”, Abstracts of Papers of the American Chemical Society, 222, U373-U373, 2001. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E 2001
Nugay, T., Nugay, N., Jerome, R., Teyssie, P., “Ambient temperature anionic polymerization of methylmethacrylate by using alkyllithium/dimethylsulfoxide initiator system.”, Abstracts of Papers of the American Chemical Society, 224, U378-U378, 2002. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E 2002
Kurt, N., Haliloğlu, T., “Distribution of cooperative interactions in barnase at different time windows by coarse grained simulations”, Polymer, 43, 2, 403-408, 2002. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2002
Doruker, P., Jernigan, R.L., Bahar, İ., “Dynamics of large proteins through hierarchical levels of coarse grained structures”, Journal of Computational Chemistry, 23, 1, 119-127, 2002. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2002
Özkan, S.B., Dill, K.A., Bahar, İ., “Fast-folding protein kinetics, hidden intermediates, and the sequential stabilization model”, Protein Science, 11, 8, 1958-1970, 2002. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2002
Işın, B., Doruker, P., Bahar, İ., “Functional motions of influenza virus hemagglutinin: A structure based analytical approach”, Biophysical Journal, 82, 2, 569-581, 2002. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2002
Doruker, P., Jernigan, R.L., Navizet, I., Hernandez, R., “Important fluctuation dynamics of large protein structures are preserved upon coarse grained renormalization”, International Journal of Quantum Chemistry, 90, 2, 822-837, 2002. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2002
Nugay, N., Nugay, T., Jerome, R., Teyssie, P., “Lithiation of toluene by organolithium compounds activated by lithium polyether alkoxides”, Journal of Molecular Catalysis A-Chemical, 179, 1-2, 59-64, 2002. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2002
Kayhan, T., Nugay, N., Nugay, T., “Metallation of mesitylene by organolithium compounds in the presence of lithium polyether alkoxides”, Turkish Journal of Chemistry, 26, 6, 965-971, 2002. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2002
Ersoy, O.G., Nugay, N., “Morphology and mechanical properties of ternary pp/pa-6/talc blends.”, Abstracts of Papers of the American Chemical Society, 224, U520-U520, 2002. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E 2002
Bağcı, Z., Jernigan, R.L., Bahar, İ., “Residue packing in proteins: Uniform distribution on a coarse grained scale”, Journal of Chemical Physics, 116, 5, 2269-2276, 2002. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2002
Bağcı, Z., Jernigan, R.L., Bahar, İ., “Residue coordination in proteins conforms to the closest packing of spheres”, Polymer, 43, 2, 451-459, 2002. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2002
Can, E., Küsefoğlu, S., Wool, R.P., “Rigid thermosetting liquid molding resins from renewable resources. II. copolymers of soybean oil monoglyceride maleates with neopentyl glycol and bisphenol a maleates”, Journal of Applied Polymer Science, 83, 5, 972-980, 2002. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2002
Doruker, P., “Simulation of polyethylene thin films composed of various chain lengths”, Polymer, 43, 2, 425-430, 2002. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2002
Kırca, S.G., Özkan, S.B., Haliloğlu, T., “Unfolding events of chymotrypsin inhibitor 2 (Ci2) revealed by Monte Carlo simulations”, Biophysical Journal, 82, 1, 134A-134A, 2002. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E 2002
Özkan, S.B., Dill, K.A., Bahar, İ., “Computing the transition state populations in simple protein models”, Biopolymers, 68, 1, 35-46, 2003. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2003
Kurt, N., Scott, W.R.P., Schiffer, C.A., Haliloğlu, T., “Cooperative fluctuations of unliganded and substratebound hiv-1 protease: A structure based analysis on a variety of conformations from crystallography and molecular dynamics simulations”, Proteins Structure Function and Genetics, 51, 3, 409-422, 2003. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2003
Ersoy, O.G., Nugay, N., “Effect of inorganic filler phase on mechanical and morphological properties of binary immiscible polymer blends”, Polymer Bulletin, 49, 6, 465-472, 2003. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2003
Doruker, P., Jernigan, R.L., “Functional motions can be extracted from on lattice construction of protein structures”, Proteins Structure Function and Genetics, 53, 2, 174-181, 2003. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2003
Kessel, A., Shental-Bechor, D., Haliloğlu, T., Ben-Tal, N., “Interactions of hydrophobic peptides with lipid bilayers: Monte Carlo simulations with m2 delta”, Biophysical Journal, 85, 6, 3431-3444, 2003. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2003
Kessel, A., Haliloğlu, T., Ben-Tal, N., “Interactions of the M2 delta segment of the acetylcholine receptor with lipid bilayers: A continuum solvent model study”, Biophysical Journal, 85, 6, 3687-3695, 2003 Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2003
Küçükpınar, E., Doruker, P., “Molecular simulations of small gas diffusion and solubility in copolymers of styrene”, Polymer, 44, 12, 3607-3620, 2003. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2003
Perisiç, O., Haliloğlu, T., Lui, H., “Multi-resolution modeling of protein dynamics-function relationship”, Biophysical Journal, 84, 2, 502A-502A, 2003. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E, CPCI-S 2003
Esen, H., Küsefoğlu, S.H., “Photolytic and free radical polymerization of cinnamate esters of epoxidized plant oil triglycerides”, Journal of Applied Polymer Science, 89, 14, 3882-3888, 2003. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2003
Eren, T., Küsefoğlu, S.H., Wool, R., “Polymerization of maleic anhydride modified plant oils with polyols”, Journal of Applied Polymer Science, 90, 1, 197-202, 2003. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2003
Kurt, N., Haliloğlu, T., Schiffer, C.A., “Structure based prediction of potential binding and nonbinding peptides to hiv-1 Protease”, Biophysical Journal, 85, 2, 853-863, 2003. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2003
Şen, S., Nugay, N., Nugay, T., “Synthesis and properties of poly(4-vinylpyridine)/montmorillonite nanocomposites”, E-Polymers, 2003. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2003
Haliloğlu, T., Kolinski, A., Skolnick, J., “Use of residual dipolar couplings as restraints in ab initio protein structure prediction”, Biopolymers, 70, 4, 548-562, 2003. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2003
Ersoy, O.G., Nugay, N., “A new approach to increase weld line strength of incompatible polymer blend composites: Selective filler addition”, Polymer, 45, 4, 1243-1252, 2004. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2004
Hamaudi, Z.T., Nugay, N., Nugay, T., “Anionic polymerization of methyl methacrylate as promoted by a n-butyl lithium-pyridazine-polyether alkoxide based complex initiator system”, Turkish Journal of Chemistry, 28, 3, 387-394, 2004. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2004
Alakent, B., Doruker, P., Çamurdan, M.C., “Application of time series analysis on molecular dynamics simulations of proteins: A study of different conformational spaces by principal component analysis”, Journal of Chemical Physics, 121, 10, 4759-4769, 2004. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2004
Yıldırım, Y., Doruker, P., “Collective motions of RNA polymerases analysis of core enzyme, elongation complex and holoenzyme”, Journal of Biomolecular Structure & Dynamics, 22, 3, 267-280, 2004. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2004
Perisic, O.Z., Haliloğlu, T., Lu, H., “Computational modeling of dynamic behavior of protein-protein interactions”, Biophysical Journal, 86, 1, 267A-267A, 2004. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E, CPCI-S 2004
Küçükpınar, E., Doruker, P., “Effect of absorbed water on oxygen transport in evoh matrices a molecular dynamics study”, Polymer, 45, 10, 3555-3564, 2004. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2004
Nugay, N., Nugay, T., Ersoy, O.G., “Effect of filler shape and compatibilizer on weld line morphology of polypropylene and polyamide-6 blend composite”, Abstracts of Papers of the American Chemical Society, 228, U348-U348, 2004. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E, CPCI-S 2004
Eren, T., Küsefoğlu, S.H., “Hydroxymethylation and polymerization of plant oil triglycerides”, Journal of Applied Polymer Science, 91, 6, 4037-4046, 2004. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2004
Li, X., Keskin, O., Ma, B.Y., Nussinov, R., Liang, J., “Interfacial pockets, structurally conserved residues and energetic hot spots in protein-protein interactions”, Biophysical Journal, 86, 1, 301A-301A, 2004. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E, CPCI-S 2004
Kürkçüoğlu, O., Jernigan, R.L., Doruker, P., “Mixed levels of coarse graining of large proteins using elastic network model succeeds in extracting the slowest motions”, Polymer, 45, 2, 649-657, 2004. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2004
Eren, T., Küsefoğlu, S.H., “One step hydroxybromination of fatty acid derivatives”, European Journal of Lipid Science and Technology, 106, 1, 27-34, 2004. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2004
Esen, H.Y., Küsefoğlu, S.H., Wool, R.P., “Photolytic and free radical polymerization of epoxidized plant oil triglycerides.”, Abstracts of Papers of the American Chemical Society, 228, U391-U391, 2004. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E, CPCI-S 2004
Nugay, N., Şen, S., Nugay, T., “Polymeric nanocomposites having block copolymers as intercalants”, Abstracts of Papers of the American Chemical Society, 228, U347-U348, 2004. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Toplantı Özeti SCI-E, CPCI-S 2004
Eren, T., Küsefoğlu, S.H., “Synthesis and characterization of copolymers of bromoacrylated methyl oleate”, Journal of Applied Polymer Science, 94, 6, 2475-2488, 2004. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2004
Eren, T., Küsefoğlu, S.H., “Synthesis and polymerization of the bromoacrylated plant oil triglycerides to rigid, flame retardant polymers”, Journal of Applied Polymer Science, 91, 4, 2700-2710, 2004. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2004
Alakent, B., Doruker, P., Çamurdan, M.C., “Time series analysis of collective motions in proteins”, Journal of Chemical Physics, 120, 2, 1072-1088, 2004. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2004
Özkan, S.B., Dalgın, G.S., Haliloğlu, T., “Unfolding events of chymotrypsin inhibitor 2 (ci2) revealed by monte carlo (mc) simulations and their consistency from structure based analysis of conformations”, Polymer, 45, 2, 581-595, 2004. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2004
Kürkçüoğlu, O., Jernigan, R.L., Doruker, P., “Collective dynamics of large proteins from mixed coarse grained elastic network model”, Qsar & Combinatorial Science, 24, 4, 443-448, 2005. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Bildiri SCI-E, CPCI-S 2005
Nugay, N., Erdodi, G., Kennedy, J.P., “Cyclosiloxane based networks: synthesis, thermal characterization, and microstructure”, Journal of Polymer Science Part A Polymer Chemistry, 43, 3, 630-637, 2005. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2005
Yılmaz, M., Küsefoğlu, S.H., “Gelation of soybean oil with polybutadiene”, Journal of Applied Polymer Science, 96, 6, 2240-2246, 2005. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2005
Alakent, B., Çamurdan, M.C., Doruker, P., “Hierarchical structure of the energy landscape of proteins revisited by time series analysis I mimicking protein dynamics in different time scales”, Journal of Chemical Physics, 123, 14, 2005. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2005
Alakent, B., Çamurdan, M.C., Doruker, P., “Hierarchical structure of the energy landscape of proteins revisited by time series analysis II investigation of explicit solvent effects”, Journal of Chemical Physics, 123, 14, 2005. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2005
Haliloğlu, T., Keskin, O., Ma, B.Y., Nussinov, R., “How similar are protein folding and protein binding nuclei? Examination of vibrational motions of energy hot spots and conserved residues”, Biophysical Journal, 88, 3, 1552-1559, 2005. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2005
Kantarcı, N., Tamerler, C., Sarıkaya, M., Haliloğlu, T., Doruker, P., “Molecular dynamics simulations on constraint metal binding peptides”, Polymer, 46, 12, 4307-4313, 2005. Polimer Uygulama ve Araştırma Merkezi UYGAR Merkezleri Makale SCI-E 2005

Sayfalar